【转帖】电泳图的Marker阅读要点

【转帖】电泳图的Marker阅读要点

summerxx (2015-7-01 15:53:28)

同意你的观点,有的时候最后一条带是看不见的那

黄花菜 (2015-7-01 15:54:05)

是应该从大条带端开始数,原因有二:

1. 小条带跑得快,时间长了可能会跑出胶,所以电泳时要注意好时间;

2. 在电泳过程中EB是向阴极端运动,所以跑到凝胶下缘的条带染色很弱甚至不染色,也会看不到!必要时建议灌制长胶。

vtongli (2015-7-01 15:54:33)

marker中的小条带分子量较小,跑的时间长了容易弥散而导致看不清楚

toy (2015-7-01 15:56:12)

同意上面的说法,最近也在跑电泳,我每次也是从最下面数的,上面的条带有时候颜色很浅看不出来!

bring (2015-7-01 16:01:04)

QUOTE:

原帖由 toy 于 2015-7-1 15:56 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

同意上面的说法,最近也在跑电泳,我每次也是从最下面数的,上面的条带有时候颜色很浅看不出来! 正解。

dog002 (2015-7-01 16:01:21)

另外还有一些商用Marker,有一个条带亮度超过其他条带(比如为其他的两倍),比较容易分辨,也可以帮助定位!

eor (2015-7-01 16:01:57)

是啊,最小的一条带肯定不能作为判断的依据,电泳液的新旧,时间长短和电流大小往往会造成最小的一条带减弱,从而导致判断失误。

现在很多marker中间位置一般都会有一条较亮的带,可能是400,500,或者600,这个要看说明书。而且很多marker都会有浓度,可能作为相对EB就会使整块胶的背景一致,使小的条带也无处遁形。呵呵。

其实,任何简单的实验都不能忽视说明书,而想当然去做。

ha111 (2015-7-01 16:02:17)

QUOTE:

原帖由 黄花菜 于 2015-7-1 15:54 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

是应该从大条带端开始数,原因有二:

1. 小条带跑得快,时间长了可能会跑出胶,所以电泳时要注意好时间;

2. 在电泳过程中EB是向阴极端运动,所以跑到凝胶下缘的条带染色很弱甚至不染色,也会看不到!必要时建议灌制长胶。 ... 这种说法欠妥,在很多情况下,许多较大的条带都没跑开,特别是目的基因较小的时候,往往不会跑很长时间。因此,Marker的判断需要根据胶浓度、电泳时间等综合判断,一般来说从小条带开始数是合理的,当然,前提是不要跑过,因此,可以在电泳跑了一半时查看一下。另外,需要结合中间位置的某几条特征条带(这几条带的亮度和分布间距都是很容易判断的),这样基本上不会出错。

8s5g (2015-7-01 16:03:38)

我最近刚刚开始遗传科室的科研实习,正在做SDS-PAGE和琼脂糖凝胶电泳,前辈们的讲解很受益呀,学习了~~

mickeylin (2015-7-01 16:03:55)

所有的MARK都有一个“加亮带”即浓度最大的带,以这条带为基准,就不会搞错了。

mickeylin (2015-7-01 16:06:10)

这种说法欠妥,在很多情况下,许多较大的条带都没跑开,特别是目的基因较小的时候,往往不会跑很长时间。因此,Marker的判断需要根据胶浓度、电泳时间等综合判断,一般来说从小条带开始数是合理的,当然,前提是不要跑过,因此,可以在电泳跑了一半时查看一下。另外,需要结合中间位置的某几条特征条带(这几条带的亮度和分布间距都是很容易判断的),这样基本上不会出错。

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1、其实楼上几位都有各自道理,没有谁的绝对错误,只是需要把实验条件说清楚!

(1)如果电泳时间短(<10分钟),大条带没有跑开,不易分辨,此时可结合marker中的特征条带进行识别;

(2)如果电泳时间适中(15分钟左右),条带基本都可以跑开,此时可从大条带数起,也可使用特征条带来快速定位;

(3)如果电泳时间过长(>15分钟),小条带可能会跑出胶外或因为所处位置EB浓度的降低而不易识别,此时最好从大条带数起,也可使用特征性条带来快速定位。

2、个人经验,最好买带有特征条带的marker,虽然贵一些,但不论在电泳的什么条件下,均容易快速、准确的识别条带。

3、个人认为,如果所用marker没有特征条带,最好从大条带数起,如果因为电泳时间短,大条带没有跑开,可以继续电泳数分钟,直至大条带跑开为止。不应从小条带开始。

dior (2015-7-01 16:06:29)

不要听老师说,或者师兄说,一定要亲自读一读说明书。

veiwu (2015-7-01 16:07:12)

QUOTE:

原帖由 mickeylin 于 2015-7-1 16:03 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

所有的MARK都有一个“加亮带”即浓度最大的带,以这条带为基准,就不会搞错了。 相当同意

dog002 (2015-7-01 16:07:53)

对,一定要自己试过才知道

如果想看小于100bps的条带,电泳时间还是不要超过15分钟。我用200v,15分钟,可以很清楚地看到。时间比电压更关键,我个人感觉。时间过长,我也看得到。。只不过不那么亮了。O(∩_∩)O~多加点EB

finger (2015-7-01 16:08:34)

请教跑的是琼脂糖还是聚丙烯酰胺?百分之几的胶?

cj_mondy (2015-7-01 16:09:42)

这么数未免有点片面,数错了活该。

对marker条带,首先要作的是看看跑出的条带与marker应有的条带数量是否一致,其次要看条带的位置分布特征与marker说明书上标准图形是否一致。

发生条带数量不一致的情况大致会有两种,一种是条带过密,没法数准。另一种就是小分子量的条带跑到外面去了。这时候最可靠的判断方法应该是根据条带间距特征与亮度特征来分辨条带的分子量。

2541 (2015-7-01 16:10:23)

同感,MARK很重要,学会正确看条带,对实验结果的判断非常重要。我喜欢用有标记的MARK。

dior (2015-7-01 16:12:22)

配的胶的浓度很重要,常常出现不同的问题!!

dog002 (2015-7-01 16:12:52)

对于商品化的marker拿到后连说明书都不看就做试验,你也真够牛的!可能“懒”更贴切些!

这种帖别说技术含量连基本常识都不明确还自以为发现新大陆般给boss报告!?

唉!

居然还要求加分,真是够厚的了!

dog002 (2015-7-01 16:13:11)

QUOTE:

原帖由 cj_mondy 于 2015-7-1 16:09 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

这么数未免有点片面,数错了活该。

对marker条带,首先要作的是看看跑出的条带与marker应有的条带数量是否一致,其次要看条带的位置分布特征与marker说明书上标准图形是否一致。

发生条带数量不一致的情况大致会有两种,一种是条 ... 支持!

的确是活该!

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